Nhiều doanh nghiệp sản xuất phân bón tại các tỉnh ĐBSCL cho rằng qua hơn 8 năm thực hiện Luật số 71 (ngày 26/11/2014) sửa đổi, bổ sung một số điều của các luật về thuế lại quy định phân bón, máy móc, thiết bị chuyên dùng phục vụ sản xuất nông nghiệp thuộc đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng kể từ ngày 1/1/2015, đã ảnh hưởng đến sản xuất bởi không cạnh tranh phân bón nhập khẩu, trong khi sản xuất trong nước tăng lên do toàn bộ chi phí phát sinh về thuế giá trị gia tăng được các doanh nghiệp tính vào chi phí sản xuất.
Không mở rộng sản xuất lớn, chỉ sản xuất cầm chừng, thời gian qua, từ khi áp dụng theo Luật thuế số 71, Công ty Cổ phần phân bón hóa chất Cần Thơ giữ nguyên hiện trạng, vì theo công ty sản lượng đang sụt giảm do không cạnh tranh được với phân bón nhập khẩu.
Đây là hiện trạng chung của nhiều nhà máy phân bón. Một trong những nguyên nhân khiến giá thành phân bón sản xuất trong nước tăng lên do toàn bộ chi phí phát sinh về thuế giá trị gia tăng được các doanh nghiệp tính vào chi phí sản xuất.
Hiện các nhà máy sản xuất phân bón cho rằng, bất lợi hiện nay trong cạnh tranh với hàng hóa nhập khẩu cùng loại không khuyến khích doanh nghiệp đầu tư, mua sắm, sửa chữa, nâng cấp tài sản cố định để tạo ra sản phẩm chất lượng cao.
Ổn định sản xuất, nâng cao thu nhập cho doanh nghiệp phân bón trong nước, hạ giá thành cho người nông dân là điều cần thiết hiện nay.